L'adolescent est une personne taciturne et réservé. On dit de lui qu'il est inquiétant, prenant toujours des airs de vilain personnage. Il serait aussi introverti depuis toujours, en raison d'un événement marquant de son enfance. Malgré ce caractère dur à vivre, ses camarades du Seed lui accorde une confiance absolue lors de leur missions : Squall possède un sens des responsabilités et de la justice très prononcé. Il toujours enclin à agir vite, et ne manque jamais à son devoir. Même si ses frères d'armes trouvent son caractère difficile, beaucoup l'admirent, et n'hésite pas à se tourner vers lui en cas d'urgence, car il est un leader né. Au cour des évènements, Cid Kramer, le directeur de la BGU, le nommera responsable provisoire, un titre qui ne manquera pas d'ennuyer le jeune homme. Il le mènera malgré tout à bien, à la plus grande joie de ses partenaires. Son masque finira par tomber après sa rencontre avec Linoa, dont la joie de vivre et l'insouciance le feront changer du tout au tout. D'un garçon renfermé, il s'ouvrira aux autres plus facilement, laissant, pour une fois, parler son cœur.  (C'est beau ce que je dis punaise )    

Squall a été formé à la BGU juste après avoir était soit-disant abandonné par sa soeur, Ellone, alors qu'ils étaient élevés dans un orphelinat, exilé aux confins du continent de Centra. Il appris à manier la Gunblade, une arme dont l'entrainement était des plus hardus. Il montra une certaine facilité à apprendre, et gravis ainsi rapidement les échelons. Il devint facilement le modèle de plusieurs élèves, notamment de Zell Dincht, un jeune homme du même âge qui ne tardera pas à le rejoindre dans sa future quête, mais aussi le rival du narcissique Seifer Almasy, qui le blessera à vie d'une cicatrice entre les deux yeux, que Squall lui rendra la seconde d'après. 
Après avoir réussi le test dans la Mine de Souffre qui allait faire de lui un véritable Seed, Squall prit la direction de Dolet, un pays en guerre contre la contrée de Galbadia, pour épauler les troupes envahies. Accompagnés par Selphie Tilmitt et de Zell, ils finiront leur mission sans Seifer, étant, au départ, le leader du groupe. Ensemble, le trio remarquera que l'armée Galbadienne a remis en marche la tour hertzienne, dont l'utilisation fut interdite une vingtaine d'année plus tôt. Malgré ces trouvailles troublantes, le groupe rentrera sain et sauf à la BGU, non sans l'aide inattendue de Quistis Trèpe, le professeur de Squall, d'un an son ainé. Entre temps, Squall rêve des aventures d'un certain Laguna Loire et de ces deux compagnons Kiros et Ward. Cela le reprendra à plusieurs reprises. Suite à sa promotion de Seed, le jeune homme est envoyé aider un groupe de résistant dans la ville de Timber, elle aussi en proie des Galbadiens. Là-bas, il fera la connaissance d'une jeune fille de son âge, Linoa Heartilly. Paressant détestable pour Squall, il se rendra lentement mais surement qu'elle a changé sa vie. Le but du camp de résistant était de kidnapper le président de Galbadia, mais cela se solda par un échec : Ils avaient été dupés ! Un écran géant au milieu de la ville s'allume alors, présentant le président, en plein discours. D'abord étonné, car cet écran n'avait plus servi depuis dix-sept ans, le groupe rejoint aussitôt Quistis sur le plateau du tournage, ou Squall retrouve Seifer, qui avait mystérieusement disparu au cours de leur mission à Dolet. Soudain, la Sorcière Édéa apparaît, emportant le rival du protagoniste avec elle. On apprendra plus tard l’exécution de ce dernier. Voulant en savoir plus, notre petite bande retrouve la femme, et après un duel acharné, elle transperce l'épaule de Squall de sa magie des glaces, arrêtant ainsi toute l'équipe, qui sera envoyée en prison. 
Ils s'échapperont en apprenant que Seifer est devenu le chevalier de la Sorcière Édéa, ayant récemment assassiné le président. Leur groupe se séparera en deux, l'un des deux, dirigés par Selphie, sera chargée d'arrêter le lancement des missiles prévu sur la BGU, que Squall transformera en forteresse mobile pour éviter les projectiles. Seulement, incapable de manier la bâtisse, elle s'écrasera en plein milieu de l'océan, dans la ville d'Horizon. La bas, ils stopperont de peu l'attaque des force Galbadiennes, à la recherche d'une jeune femme appelée Ellone. Cid révèlera qu'il est en réalité l'époux de Édéa, celle qui a fondé le BGU. Le Président nommera Squall pour le remplacer, préférant s'isoler dans son coin. Loin d'apprécier cette alternative, le jeune Seed se retire dans sa chambre. Ils dirigeront ensuite le vaisseau vers l'université de Trabia, où Selphie était élève. Elle est aussi ravagée que la faculté, détruite par l'assaut des missiles. Irvine Kinneas, un tireur d'élite de la fac de Galbadia les ayant rejoins après leur passage à Deling City, leur rappelle à tout leur passé commun, dans l'orphelinat de Centra, où ils étaient tous, sauf Linoa, et sous la tutelle de Édéa Kramer. Cette révélation fut un choc. Malheureusement, il n'ont pas une minute de répis : la Fac de Galbadia, elle aussi devenue mobile, attaque la BGU ! Squall dirigera la défense de leur faculté, encourageant ses troupes au passage. Il réussira à s'introduire dans le bâtiment ennemi, pour y retrouver Édéa et Seifer. Leur ancienne gouvernante leur expliquera qu'elle était sous le contrôle de la puissante sorcière Ultimecia, et qu'elle n'agissait pas de son plein gré. Mais pour Squall, le plus important reste l'état de la jeune fille qu'il a rencontré à Timber : Linoa est mystérieusement tombée dans un profond coma. 
Inquiet pour son état, Squall décide d’amener Linoa à Ellone, qui, plus tôt, lui avait révélé qu'elle avait le pouvoir de faire voyager des gens dans le passé des autres, comme elle avait fait avec lui et Laguna Loire. Il se dit qu'elle pourra lui montrer pourquoi la jeune fille aux cheveux noirs est dans cet état. Son voyage le mène à Esthar, une nation n'ayant plus aucun contact avec le monde extérieur depuis dix-sept ans. Ici, il apprend que Ellone se trouve dans la base lunaire de la ville, là où Squall apprendra qu'il doit se rendre dans l'espace pour la retrouver. Ce que lui et ses compagnons font. Une fois là haut, Squall ne tarde pas à apprendre qu'Ellone ne peut rien pour Linoa, elle qui ne la connait pas, elle ne peut pas envoyer Squall dans son passé, mais lui promet cependant de faire ce qu'elle peut. Le brun l'amène donc au chevet de Linoa, mais la même sorcière Ultimecia prend possession d'elle, libérant une autre sorcière d'antan, Adel, de sa prison de glace. Prenant possession de cette dernière, elle laisse le corps de Linoa à la dérive dans l'espace, tandis que la base lunaire du groupe est sur le point d'être détruite. N'écoutant que ses sentiments, Squall sort du camp, puis sauve Linoa d'une mort certaine. Coup de chance pour eux, ils trouvent un vaisseau à la dérive, du nom de l'Hydre, qu'ils débarrasseront de tous ses monstres. Après une scène touchante, les deux compagnons reçoivent un message d'Esthar, leur expliquant que l'actuelle Sorcière Linoa devait être remise aux mains des scientifiques de la cité. Ultimecia ayant pris possession d'elle, la jeune fille de Timber était maintenant devenue une menace pour la planète, et c'est par choix qu'elle se rendit aux autorités, laissant derrière elle un Squall de nouveau déprimé. L'intervention de Quistis, le rabrouant au sujet de l’abandon de Linoa, le remis sur le droit chemin, vers le Mausolée, ou Ward leur ouvrit la voie, bloquée par les Esthariens. Squall libéra Liona de force, l’enlaçant avant de se diriger vers l'orphelinat où ils devraient retrouver Édéa et Cid Kramer. Songeuse au sujet du futur, Linoa perdit pied. Squall lui assura qu'il la protégera, même si le monde était contre elle. Ils se promirent que, si ils devaient être séparés, ils se retrouveraient dans le champ fleuris derrière le bâtiment de l'orphelinat. Retournant à Esthar sur demande du président qui n'est autre que ce bon vieux Laguna Loire, le groupe apprend que ce dernier a un plan pour éliminer Ultimecia à jamais, elle qui veut accomplir une « Compression Temporelle », un acte qui détruira le monde. Le groupe monte à bord de l'Hydre et se dirige vers Lunatic Pandora, le lieux où Ellone est retenue captive. La bas, ils affrontent Adel, après avoir tenté de raison Seifer, en vain. N'ayant plus de corps à posséder, Ultimécia utilise celui de Linoa, ce qui permet à Ellone d'extirper son esprit du corps de la jeune fille. Ultimécia commence alors sa Compression, ce qui permet aux compagnons de voyager dans le futur, et d'arriver au palais de la nécromancienne, où, après multiples énigmes et affrontements, ils suppriment définitivement la sorcière. Ultimecia et Squall reviennent dans le passé et apparaissent à l'Orphelinat d'Edea, où Squall rencontre Edea et lui parle de la BGU et du SeeD. Squall assiste au moment où Ultimecia transfère ses pouvoirs à Edea avant de mourir. Puis, le jeune homme tombe dans le temps compressé. Il essaye de se frayer un chemin et de retrouver la prairie dans laquelle lui et Linoa ont promis de se rejoindre. Malheureusement, Squall est enfermé dans le néant. Linoa utilise alors ses pouvoirs de sorcière pour le retrouver et finit par le ramener vivant avec elle. 
Durant la fête prenant place à la BGU, Squall sourit à Linoa après que celle ci lui ait montré une étoile filante, levant l'index vers le ciel comme à son habitude, puis l'embrassa sur le balcon d'une BGU volant vers le clair de lune.